Н.В. Шеховцова, заведующий кафедрой

В 1971 году одновременно с началом подготовки биологов в университете организуется кафедра экспериментальной ботаники, возглавляемая кандидатом биологических наук Вадимом Васильевичем Романовичем.

Расширение кафедры происходит в 1977 году с присоединением к ней химического цикла. Кафедра получает название экспериментальной ботаники и биохимии, ее руководителем становится кандидат педагогических наук Владимир Николаевич Алексинский. В 1980 году кафедру возглавляет профессор, доктор биологических наук Ольга Васильевна Титова.

В 1983 году происходит отделение от кафедры дисциплин химического цикла, и она называется кафедрой ботаники и физиологии растений. С 1992 года кафедрой, которая получает современное название, руководит профессор, доктор биологических наук Надежда Владимировна Верховцева.

С 2000 года кафедрой заведует кандидат биологических наук, доцент Нина Валентиновна Шеховцова.

НАУЧНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ НА КАФЕДРЕ:

• ботаника

• физиология растений

• микробиология

• молекулярная биология

• почвоведение

НА КАФЕДРЕ РАБОТАЮТ

• 2 доктора
• 7 кандидатов наук;
• учебный процесс обеспечивает учебно-вспомогательный персонал в количестве 8 сотрудников.

Преподаватели и сотрудники кафедры ботаники и микробиологии: в нижнем ряду – доцент М.А. Борисова, зав. кафедрой Н.В. Шеховцова, доцент О.А. Маракаев, доцент И.Н. Волкова; в среднем ряду – доцент Г.В. Кондакова, доцент Ю.В. Зайцева, старший лаборант И.В. Злобин, доцент Н.Ю. Пухова, старший лаборант Ю.Ю. Хмарук, зав. лабораторией О.А. Жилкина, старший лаборант Н.К. Казанова; в верхнем ряду – лаборанты А.С. Александрова и А.А. Бычкова.

Подготовка кадров высшей квалификации: 

За годы работы на кафедре подготовила и защитила докторскую диссертацию Н.В. Верховцева (в настоящее время профессор Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова). 

За период существования кафедры ее выпускниками подготовлено и защищено более 20 кандидатских диссертаций (научные руководители – О.В. Титова, Н.В. Верховцева, Н.В. Шеховцова и др.). 

Ежегодно на кафедре обучаются несколько аспирантов по направлению 06.06.01 Биологические науки (профили «Физиология и биохимия растений» и «Микробиология»).

ЛЕКЦИОННЫЕ КУРСЫ ПО БАЗОВЫМ ДИСЦИПЛИНАМ:

• Ботаника

• Физиология растений

• Микробиология и вирусология

• Молекулярная биология

• Биоразнообразие

• Почвоведение

• Охрана окружающей среды

ПРОФИЛЬНЫЕ КУРСЫ:

• Современные биотехнологии

• Биоинженерия

• Современные методы молекулярной биологии

• Иммунология

• Введение в биотехнологию

• Культивирование микроорганизмов и клеток

• Современные методы биотехнологий на фармпредприятии

• Экологическая биотехнология

• Методы экологических исследований

• Экология популяций и сообществ

• Экология организмов

• Экологическая эпидемиология и паразитология

• Экспериментальная ботаника

• Мониторинг растительно-почвенного покрова

• Природоведческая микробиология

• Введение в специальность 

• Геоботаническая экспертиза

ПРАКТИКИ НА БИОЛОГИЧЕСКОЙ СТАНЦИИ:

• По получению первичных профессиональных умений и навыков (Морфология и анатомия растений, Альгология и микология, Экология растений)

• По получению первичных профессиональных умений и навыков, в том числе первичных умений и навыков научно-исследовательской деятельности (Ботаника)

• Специальная практика по биоэкологии (Вегетационные методы экологической физиологии)

• Комплексная практика по экологии (Геоботаника, Почвоведение)

• Дополнительные образовательные программы:

• Микробиологический контроль качества при производстве лекарственных средств. Программа повышения квалификации, 2015 (руководитель – Н.В. Шеховцова, по заказу АО «Р-Фарм»)

• Микробиологический анализ (контроль) воды в системах водоснабжения, водоотведения и теплоснабжения. Программа повышения квалификации, 2019 (руководитель – Н.В. Шеховцова, по заказу АО «Ярославльводоканал»)

• Отраслевые биотехнологии и биоинженерия. Программа «Новые возможности для каждого» в рамках нацпроекта «Образование», 2019– 2020 (руководитель – О.А. Маракаев)

• Микробиология. Микробиологический контроль качества воды на всех этапах водоснабжения, водоотведения и теплоснабжения. Программа переподготовки кадров, 2020 (руководитель – Н.В. Шеховцова, по заказу АО «Ярославльводоканал») 

ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ НАУЧНОЙ И НАУЧНО-МЕТОДИЧЕСКОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ

• Растительный покров природных и антропогенных ландшафтов Ярославского Поволжья

• Оценка современного состояния флоры и микобиоты Верхне-Волжского региона (видовое и популяционное разнообразие, динамика, флористические комплексы редких и исчезающих видов)

• Изучение флоры и растительности Верхне-Волжских водохранилищ, малых рек и озер Ярославского Поволжья, биологии макрофитов

• Лихенология, лихеноиндикация и микология

• Физиологическая и популяционная экология орхидных Центрально-Европейской России

• Ассоциативная микробиота растений, анализ бактериальных сообществ и поиск штаммов, обладающих биотехнологическим потенциалом

• Биоэкологический мониторинг природных объектов, особо охраняемых природных территорий и ведение региональной Красной книги

• Изучение механизмов формирования и методов борьбы с бактериальными биопленками, Quorum Sensing-систем регуляции экспрессии генов у бактерий

• Подземная микробиология – изучение биоразнообразия, трофических связей, динамики микробных ценозов подземных вод и горных пород

• Микробиологический мониторинг и оценка состояния поверхностных и подземных вод

• Почвенный экологический мониторинг 

• Трансформация нитроароматических соединений гетеротрофными бактериями; исследование микробоценозов оглееных горизонтов почв

НАУЧНЫЕ ПРОЕКТЫ

НИР «Разработка методики изучения подземной биосферы по образцам керна и флюидов глубоких и сверхглубоких скважин». Договор с ФГУП НПЦ «Недра» (2000–2004 гг.)

НИР «Изучение состояния вод сбросного канала по микробиологическим показателям». Договор с Ярославской экологической кампанией (2004–2005 гг.)

Грант компании Ford Motor Company «Разработка методики изучения подземной биосферы по образцам кернов и флюидов глубоких и сверхглубоких скважин» (2005)

НИР «Разработка баз данных о состоянии региональных особо охраняемых природных территорий Центрально-Европейской части России (на примере Владимирской и Ярославской областей)». Проект Международного союза охраны природы BBI-Matra 2007/041 (2007)

НИР «Таксономическая структура микробных сообществ как показатель биомониторинга осадков, почв и пород». Государственное задание Минобрнауки РФ (2009)

НИР «Экологический мониторинг почв биологическими и физико-химическими методами». Государственное задание Минобрнауки РФ (2010)

НИР «Физиология и популяционная экология редких видов орхидных» Государственное задание Минобрнауки РФ (2011)

НИР «Разработка системы биотехнологического культивирования орхидных России в условиях in vitro, оценка их жизненного состояния и проведения экологического мониторинга в целях сохранения редких видов». Государственное задание Минобрнауки РФ (2012–2013 гг.)

НИР «Исследования краснокнижных видов на территории НП «Плещеево озеро». Договор с НП «Плещеево озеро» (2013)

НИР «Работы по сбору, обработке, анализу данных о численности, условиях обитания и ареалах редких и исчезающих видов грибов, лишайников, растений и животных, занесенных или рекомендуемых к занесению в Красную книгу Ярославской области». Ведомственная целевая программа «Управление охраной окружающей среды и рациональным природопользованием в Ярославской области» на 2012–2014 годы (2014) 

НИР «Оценка изменения растительного покрова Национального парка «Плещеево озеро» в условиях рекреации (в районе урочища «Кухмарь»). Договор с НП «Плещеево озеро» (2014)

НИР «Комплексная биоэкологическая оценка состояния памятника природы «Дубрава деревень Чашницы, Ям» на территории Национального парка «Плещеево озеро». Договор с НП «Плещеево озеро» (2016)

НИР «Комплексная биоэкологическая оценка состояния леса в местечке «Касарка» на территории Национального парка «Плещеево озеро». Договор с НП «Плещеево озеро» (2017)

НИР «Флора реки Касть на территории государственного природного заказника федерального значения «Ярославский». Договор с НП «Плещеево озеро» (2018)

Грант Фонда содействия инновациям по программе «Умник» «Разработка нового биопрепарата для регуляции роста и защиты растений сем. Orchidaceae в культуре» (2016–2018 гг.)

Грант РФФИ 18-34-00646 «Quorum sensing регуляция в микробно-растительных сообществах (на примере Dactylorhiza incarnata) (2018–2020 гг.)

НИР «Комплексная биоэкологическая оценка состояния северного побережья озера Плещеево». Договор с НП «Плещеево озеро» (2020)

Грант Фонда содействия инновациям по программе «Умник» «Разработка тест-системы на основе мультиплексной ПЦР для обнаружения бактерий рода Aeromonas и оценки их эпидемической значимости» (2020–2021 гг.) 

Грант Фонда содействия инновациям по программе «Умник» «Разработка биопрепарата для борьбы с микотоксинами на основе генномодифицированного штамма Pseudomonas chlororaphis gpr 225 gm», (2020–2021 гг.)

Грант Фонда содействия инновациям по программе «Умник» «Разработка системы биоремедиации вод от антибиотиков группы макролидов» (2020–2021 гг.)

ОСНОВНЫЕ НАУЧНЫЕ ДОСТИЖЕНИЯ И ПРИКЛАДНЫЕ РАЗРАБОТКИ

Разработка методики исследования подземной биосферы по образцам кернов и флюидов сверхглубоких скважин: отчет о НИР/фгуп НПЦ Недра. Ярославль, 2000. 114 с. (№ госрегистрации 01.99.0007062)

Исследования по видовому разнообразию покрытосеменных растений вошли в Красную книгу Ярославской области (издания 2004 и 2015 гг.)

Разработаны паспорта особо охраняемых природных территорий Ярославской области (заказники и памятники природы)

Разработаны научные обоснования охраны 7-и природных объектов на территории национального парка «Плещеево озеро» и федерального заказника «Ярославский» 

Экология растений: электронные учебно-методические материалы. Электронная база данных. ЯрГУ, 2012 / Маракаев О.А. Свидетельство Федеральной службы по интеллектуальной собственности (Роспатента) №2012621024 от 02.10.2012 

Особо охраняемые природные территории: Верхне-Волжский регион. Электронная база данных. ЯрГУ, 2013 / Маракаев О.А., Холмогоров С.В., Сидоров А.В., Тарнуев С.В. Свидетельство Федеральной службы по интеллектуальной собственности (Роспатента) №2013620734 от 24.06.2013

Орхидные Ярославской области. Геоинформационная система. Электронная база данных. ЯрГУ, 2013 / Маракаев О.А., Тарнуев С.В. Свидетельство Федеральной службы по интеллектуальной собственности (Роспатента) №2014620419 от 12.03.2014

Лихенобиота биологического стационара ЯрГУ им. П.Г. Демидова «Улейма» и его окрестностей. Электронная база данных. ЯрГУ, 2016 / Кондакова Г.В. Свидетельство Федеральной службы по интеллектуальной собственности (Роспатента) №2016620499 от 20.04.2016

УЧЕБНЫЕ ПОСОБИЯ, ИЗДАННЫЕ СОТРУДНИКАМИ КАФЕДРЫ ЗА ПОСЛЕДНИЕ ГОДЫ

Волкова И.Н., Кондакова Г.В. Экологическое почвоведение: курс лекций для студентов-экологов (бакалавров). Ярославль: ЯрГУ, 2003. 52 с.

Шеховцова Н.В. Экологическая эпидемиология: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2004. 143 с.

Кондакова Г.В. Санитарная микробиология: текст лекций. Ярославль: ЯрГУ, 2005. 84 с.

Маракаев О.А. Экологическая физиология растений. Фотосинтез и свет. Ярославль: ЯрГУ, 2005. 95 с.

Богачев В.В., Борисова М.А., Маракаев О.А. Геоботаническая экспертиза: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2007. 150 с.

Кондакова Г.В. Биоиндикация. Микробиологические показатели: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2007. 136 с.

Шеховцова Н.В. Экология водных микроорганизмов: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2008. 132 с.

Шеховцова Н.В. Основы иммунологии: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2009. 120 с.

Борисова М.А., Богачев В.В. Биогеография: география растений. Ярославль: ЯрГУ, 2010. 126 с.

Волкова И.Н. Экологическое почвоведение: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2013. 112 с.

Шеховцова Н.В. Экологическая эпидемиология: учебное пособие. Ярославль: ЯрГУ, 2013. 112 с.

Кондакова Г.В. Большой практикум. Продукция фотосинтеза. Ярославль: ЯрГУ, 2015. 64 с.

Борисова М.А., Маракаев О.А. Редкие виды растений. Практика исследований в природе. Ярославль: ЯрГУ, 2015. 64 с.

Борисова М.А., Маракаев О.А. Редкие виды флоры биостанции «Улейма». Экологические экскурсии. Ярославль: ЯрГУ, 2015. 64 с.

Пухова Н.Ю. Бактерии в природных сообществах. Ярославль: ЯрГУ, 2016. 53 с.

Волкова И. Н. Практикум по почвоведению. Ярославль: ЯрГУ, 2016. 37 с.

Шеховцова Н.В. Микробиология и вирусология. Ярославль: ЯрГУ, 2017. 64 с.

Кондакова Г.В. Ботаника. Водоросли и грибы. Ярославль: ЯрГУ, 2018. 52 с.

Шеховцова Н.В., Зайцева Ю.В. Культивирование микроорганизмов и клеток. Ярославль: ЯрГУ, 2019. 60 с.

Шеховцова Н.В. Микробиологический контроль качества лекарственных средств. Саратов, 2019. 239 с.

Борисова М.А., Волкова И.Н., Маракаев О.А. Мониторинг растительно-почвенного покрова. Ярославль: ЯрГУ, 2020. 52 с.

ВАЖНЕЙШИЕ НАУЧНЫЕ И НАУЧНО-МЕТОДИЧЕСКИЕ ПУБЛИКАЦИИ ЗА ПОСЛЕДНИЕ ГОДЫ

Монографии

Красная книга Ярославской области. Ярославль: Изд-во Александра Рутмана, 2004. 384 с. (авторы разделов – В.В. Богачев, М.А. Борисова, О.А. Маракаев).

Горохова В.В., Маракаев О.А. Экосистемы болот Ярославской области: состояние и охрана. Ярославль: ЯрГУ, 2009. 160 с.

Кондакова Г.В., Верховцева Н.В. Микроорганизмы и их функционирование в глубинных водах. Классическая микробиология и масс-спектрометрическая диагностика. Саарбрюкен (Saarbrücken): Lap Lambert Academic Publishing, 2014. 172 с.

Красная книга Ярославской области. Ярославль: Академия 76, 2015. 472 с. (авторы разделов – М.А. Борисова, Г.В. Кондакова, О.А. Маракаев).

Экологический атлас Ярославской области. Ярославль, 2015. 154 с. (автор раздела – О.А. Маракаев).

Статьи

Маракаев О.А., Титова О.В. Активность окислительных ферментов и особенности развития микоризы в подземных органах Dactylorhiza maculata (L.) Soó на разных этапах онтогенеза // Бюллетень Главного ботанического сада. 2000. Вып. 180. С. 77–84.

Борисова М.А., Гарин Э.В., Папченков В.Г. Флористические находки на транспортных путях Ярославской области // Ботанический журнал. 2001. Т. 86. № 2. С. 111–116.

Кондакова Г.В., Верховцева Н.В., Осипов Г.А. Бактериальные процессы циклов углерода и азота в глубинных водах литосферы // Вестник Московского государственного университет. 2002. Сер. 16. Биология. № 4. С. 26–33. 

Родионова Т.А., Шеховцова Н.В., Николаев Ю.А., Паников Н.С. Рост и обратимая адгезия Bacillus licheniformis 603 в зависимости от условий культивирования // Микробиология. 2003. Т. 72. № 4. С. 521–527.

Batrakov S.G., Rodionova T.A., Esipov S.E., Polyakov N.B., Sheichenko V.I., Shekhovtsova N.V., Lukin S.M., Panikov N.S., Nikolaev Y.A. A novel lipopeptide, an inhibitor of bacterial adhesion, from the thermophilic and halotolerant subsurface Bacillus licheniformis 603 // Biochimica et Biophysica Acta (BBA). 2003. Vol. 1634. № 3. Р. 107–115.

Shekhovtsova N.V., Osipov G.A., Verkhovtseva N.V., Pevzner L.A. Analysis of lipid biomarkers in rocks of Archean crystalline basement // Proceedings of SPIE. 2003. V. 4939. P. 160–168.

Маракаев О.А., Смирнова Н.С., Загоскина Н.В. Техногенный стресс и его влияние на лиственные древесные растения (на примере парков г. Ярославля) // Экология. 2006. Т. 37. № 6. С. 410–414.

Kondakova G.V., Verkhovtseva N.V., Osipov G.A. Investigation of microbial diversity of underground waters in monitoring deep horizons of the Earth’s crust // Moscow University Biological Sciences Bulletin. 2007. Vol. 62. I. 2. Р. 69–75.

Папченков В.Г., Борисова М.А., Лисицына Л.И., Тремасова Н.А. Дополнения и поправки к «Флоре …» П.Ф. Маевского (2006) по Ярославской области // Бюллетень МОИП. Отд. биол. 2007. Т. 112. Вып. 6. С. 65–66.

Маракаев О.А., Титова О.В. Динамика содержания углеводов в вегетативных органах Dactylorhiza maculata (L.) Soó (Orchidaceae) разных возрастных состояний в зависимости от погодных условий // Бюллетень МОИП. Отдел биол. 2009. Т. 114. № 4. С. 20–27.

Кузьмина В.В., Шеховцова Н.В., Болобонина В.Е. Динамика активности протеиназ и глюкозидаз химуса рыб при его экспозиции в пресной и солоноватой воде // Известия РАН. Серия биол. 2010. № 6. С. 704–710.

Vasilev S.V., Churilov A.B., Prikhodko O.Y., Shekhovtsova N.V., Yagushkina A.Y. A Study of Calcifying Nanoparticles Extracted from Vorotilovskaya Well // J. of Material Science and Engineering. 2012. V. 2(8). P. 464–470.

Kondakova G.V., Verkhovtseva N.V., Ostroumov S.A. Study of Hydrocarbon Oxidizing Microorganisms from Deep Groundwater of the Puchezh–Katunki Impact Structure // Moscow University Biological Sciences Bulletin. 2013. Vol. 68. I. 3. Р. 119–123. 

Маракаев О.А., Целебровский М.В., Николаева Т.Н., Загоскина Н.В. Некоторые аспекты роста подземных органов пальчатокоренника пятнистого и накопления в них фенольных соединений на генеративном этапе онтогенеза // Известия РАН. Сер. биол. 2013. С. 315–323.

Шеховцова Н.В. Микробиологические исследования горных пород Воротиловского выступа Архейского кристаллического фундамента // Горный журнал. 2013. № 3 (2186). С. 31–36.

Shekhovtsova N.V., Marakaev O.A., Pervushina K.A., Osipov G.A. The underground organ microbial complexes of moorland spotted orchid Dactylorhiza maculata (L.) Soó (Orchidaceae) // Advances in Bioscience and Biotechnology. 2013. № 4. P. 35–42.

Маракаев О.А., Богомолов Ю.В., Сидоров А.В., Загоскина Н.В. Разработка нетравмирующего метода определения морфофизиологических параметров листьев орхидных (на примере Dactylorhiza maculata (L.) Soó) // Бюллетень МОИП. Отд. биол. 2014. Т. 119. Вып. 5. С. 54–65.

Маракаев О.А., Холмогоров С.В. Динамика развития микосимбионта в подземных органах Dactylorhiza maculata (L.) Soó (Orchidaceae) в течение периодов вегетации и покоя // Поволжский экологический журнал. 2015. № 2. C. 193–203.

Veselova M.A., Romanova Yu.M., Lipasova V.A., Koksharova O.A., Zaitseva Yu.V., Chernukha M.U., Gintsburg A.L., Khmel I.A. The effect of mutation in the clpX gene on the synthesis of N-acyl-homoserine lactones and other properties of Burkholderia cenocepacia 370. // Microbiological Research, 2016. V.186. P.90-98. 

Сидоров А.В., Зайцева Ю.В., Маракаев О.А. Морфофизиологические особенности семян двух видов орхидных Центрально-европейской России и их способность к прорастанию в культуре in vitro // Вестник Тверского государственного университета. Серия: Биология и экология, 2018. № 4. С.143-153. 

Сечин Е.Н., Маракаев О.А., Гаврилов Г.Б. Аминокислотный состав вегетативных органов Dactylorhiza maculata (L.) Soó (Orchidaceae) // Химия растительного сырья. 2019. № 2. С. 135–143.

Зайцева Ю.В., Сидоров А.В., Маракаев О.А., Хмель И.А. Растительно-микробные взаимодействия с участием Quorum sensing регуляции // Микробиология. 2019. № 5. Т. 88. С. 519–531.

Zaitseva Y.V., Lipasova V.A., Plyuta V.A., Koksharova O.A., Demidyuk I.V., Kostrov S.V., Khmel I.A. Effect of inactivation of luxS gene on the properties of Serratia proteamaculans 94 strain. // Folia microbiologica, 2019. V. 64. №. 3. P.265-272.

Zaitseva Y.V., Koksharova O.A., Lipasova V.A., Plyuta V.A., Demidyuk I.V., Chernin L.S., Khmel I.A. SprI/SprR Quorum Sensing System of Serratia proteamaculans 94. // BioMed Research International, 2019. Article ID 3865780

Сидоров А. В. , Зайцева Ю. В. , Маракаев О. А. Влияние культуральной жидкости ассоциативных бактерий рода Pseudomonas на прорастание, морфогенез и рост Dactylorhiza incarnata (L.) Soo (Orchidaceae) в культуре in vitro // Вестн. Том. гос. ун-та. Биология, 2020. №51. С. 6-24.

Зайцева, Ю. В., Липасова, В. А., Кокшарова, О. А., Плюта, В. А., Демидюк, И. В., Чернин, Л. С., Хмель, И. А. Особенности quorum sensing системы SprIR Serratia proteamaculans 94 и ее участие в регуляции клеточных процессов. //Генетика, 2021.  Т. 57. №. 2. С. 165-178.

Petrushin I. S., Markova Y. A., Karepova M. S., Zaytseva Y. V., Belovezhets L. A. Complete Genome Sequence of Rhodococcus qingshengii Strain VKM Ac-2784D, Isolated from Elytrigia repens Rhizosphere // Microbiology Resource Announcements. 2021. V. 10. №. 11. P. e00107-21.

Tsaplina O, Khmel I, Zaitseva Y, Khaitlina S. Invasion of Serratia proteamaculans is regulated by the sprI gene encoding AHL synthase. Microbes Infect. 2021. V. 23. №. 9-10. P. 104852.

Tsaplina, O.; Khmel, I.; Zaitseva, Y.; Khaitlina, S. The Role of SprIR Quorum Sensing System in the Regulation of Serratia proteamaculans 94 Invasion. Microorganisms 2021, V. №. 10. 2082.