Размер:
A A A
Цвет: C C C
Изображения Вкл.Выкл.
Обычная версия сайта
Demidov Yaroslavl State University

Демидовский университет запустил образовательный интенсив "Digital Biology"

Aa
01.06.2022
Демидовский университет запустил образовательный интенсив "Digital Biology"

Главная цель новой программы для студентов – формирование компетенций по использованию цифровых технологий при решении задач биоинформатического анализа нуклеотидных и аминокислотных последовательностей. Составила курс заместитель декана факультета по научной работе Юлия Зайцева.

Участники интенсива расширят свои представления об анализе, интерпретации и визуализации различных биологических данных, научатся эффективному взаимодействию с современными источниками информации, включающими новое поколение биологических информационных ресурсов, и получат полезный опыт для дальнейшего решения практических задач биоинформатического анализа нуклеотидных и аминокислотных последовательностей.

Курс специалисты ЯрГУ составили совместно со старшим научным сотрудником Лаборатории метаболизма экстремофильных прокариот Федерального исследовательского центра биотехнологии РАН Александрой Клюкиной и доцентом кафедры естественнонаучных дисциплин факультета бизнес-коммуникаций и информатики Иркутского государственного университета Иваном Петрушиным.

Модуль программы «Анализ белковых структур», подготовленный Александрой Клюкиной, посвящен основам структурной организации белковых молекул. В практической части модуля будут описаны методы определения и предсказания белковых структур, а также инструменты для работы с 3D-моделями, будет рассмотрен метод in silico сайт-направленного мутагенеза для предсказания вклада различных аминокислотных остатков в функциональные особенности ферментов. Студенты самостоятельно проведут сравнительный анализ аминокислотных последовательностей и построение 3D-моделей белков.

Модуль Ивана Петрушина «Моделирование взаимодействия белков с малыми молекулами. Молекулярный докинг» рассматривает вопросы изучения механизмов взаимодействия белков с малыми молекулами с помощью методов биоинформатики. Для исследования связи белка-мишени и малой молекулы используются различные методы молекулярного моделирования, один из наиболее простых и доступных – метод молекулярного докинга. Он заключается в поиске наиболее энергетически выгодной конформации (пространственной ориентации) с помощью эффективного перебора вариантов. В практической части модуля студенты познакомятся с программой AutoDock Vina и проведут исследование регуляции активности рецептора в бактериальной синтазе целлюлозы.

Возврат к списку