Искусствовед, музейный деятель, профессор, преподаватель Ярославского государственного университета (1918—1924). Родился в Петербурге в 1877 году в семье земского статистика. Окончил 2-ю Московскую гимназию. В 1900 году поступил на историко-филологический факультет Московского университета. Окончил университет в 1904 году. С 1904 по 1916 год работал преподавателем учительской семинарии в Новгородской губернии. В этот период активно занимался изучением памятников церковной архитектуры, собирал церковную утварь. На основе собранной коллекции в 1913 году было создано Новгородское епархиальное древлехранилище, где Александр Иванович организовал реставрационную мастерскую. В это же время был профессором в Новгородском народном университете. В 1916 году возвратился в Петроград и до 1918 преподавал в Петергофской гимназии. С 1918 по 1919 год работал в музейном отделе Народного комиссариата просвещения. По приглашению художника и искусствоведа Игоря Эммануиловича Грабаря стал сотрудником, а впоследствии и научным руководителем Комиссии Наркомпроса по сохранению и раскрытию памятников искусства и по реставрации настенной живописи и древних икон. В июне 1919 года был арестован в Петергофе, освобожден по ходатайству Натальи Ивановны Седовой (гражданской жены революционера и политического деятеля Льва Троцкого). Продолжал работать в Комиссии по сохранению и раскрытию памятников искусства до 1924 года. В 1924 году эта Комиссия была переименована в Центральные государственные реставрационные мастерские, в которых Анисимов занял должность научного руководителя реставрации памятников искусства. В 1920—1929 годах работал в Государственном Историческом музее в должности заведующего отделом памятников религиозного быта. В 1921 году был арестован в Екатеринбурге и приговорен к шести месяцам принудительных работ без содержания под стражей. 3 февраля 1921 года освобожден досрочно. Участвовал в сохранении национального культурного наследия, возглавлял реставрационные работы в Новгороде, Ярославле, Ростове, Угличе, Владимире. Среди множества отреставрированных под его руководством памятников можно выделить следующие: иконы и настенную живопись, связанные с именем Феофана Грека, в Москве и Новгороде; иконы «Троица» и «Звенигородский чин» Андрея Рублева; Богородичные иконы «Владимирская», «Боголюбская», «Максимовская», «Знамение», «Оранта», «Толгская», «Федоровская», «Донская». Организовал специальные реставрационные мастерские в Новгороде, Ярославле, Вологде. Одновременно преподавал в Московском университете, в Высших художественно-технических мастерских (ВХУТЕМАС), в начале 1920-х годов работал в Московском институте историко-художественных изысканий и музееведения, Московском НИИ археологии и искусствознания, Государственной Академии художественных наук. В Ярославском университете занимал должности заведующего кабинетом изящных искусств (1918—1919), профессора кафедры археологии и материальной культуры (1919—1924), декана исторического отделения (с 20 февраля 1920 года). Читал курсы: история русского искусства, раннее христианское искусство, введение в искусство понимания, русское искусство до XVIII века. С 1925 по 1930 год руководил ярославским филиалом живописной секции Центральных государственных реставрационных мастерских. Участвовал в организации передвижной выставки русских икон в Европе и США (1929—1932). 6 октября 1930 года был арестован в Москве по делу о «шпионаже и вредительстве через Центральные государственные реставрационные мастерские». 21 января 1931 года был осужден на 10 лет лагерей. Отбывал наказание в Соловецком лагере особого назначения (Кемский лагпункт). С мая 1931 до середины 1932 работал в музее Соловецкого лагеря, реставрировал иконы, читал доклады. В 1937 году был переведен в Беломоро-Балтийский лагерь (лагпункт Кузема). 22 августа 1937 года был арестован в лагере, 26 августа Тройкой НКВД Карельской АССР приговорен к расстрелу. Расстрелян 2 сентября 1937 года в урочище Сандармох (ст. Медвежья гора). Сейчас на этом месте мемориальное кладбище «Сандармох». Полностью реабилитирован прокурором Карелии в 1989 — 1990 годах.

Гущина Е. В. Биографический сборник Демидовского университета / Е. В. Гущина, Д. К. Морозов, Ю. Г. Салова. — Ярославль, Рыбинск: Изд-во «Рыбинский Дом печати» — С. 38-41

Поэт и художник Максимилиан Волошин посвятил своему ближайшему другу Александру Ивановичу Анисимову стихотворение «Владимирская Богоматерь» (26 мая 1929 г.). Художник Б. М. Кустодиев написал его портрет в 1915 году.

1. Анисимов, А. И. Новгородская икона св. Федора Стратилата / А. И. Анисимов, П. П. Муратов. Памятники древне-русской живописи. — М.: К. Ф. Некрасов, 1916. — 48 с.
2. Анисимов, А. И. Реставрация памятников древнерусской живописи в Ярославле. 1919—1926. / А. И. Анисимов. — М.: Центральные государственные реставрационные мастерские, 1926. — 16 с.
3. Анисимов, А. И. Домонгольский период древнерусской живописи / А. И. Анисимов // Вопросы реставрации: сборник Центральных Государственных Реставрационных Мастерских. Вып. 2 / Под ред. И. Э. Грабаря. — М.: Центральные государственные реставрационные мастерские, 1928. — 284 с.
4. Анисимов, А. И. Владимирская икона Божией Матери / А. И. Анисимов. — Прага: Seminarium Kondakovianum, 1928. — 36 с.